Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RPEL1-201ENST00000441178 2130 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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