Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
C18orf8Q96DM3 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms