Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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COL24A1Q17RW2 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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COL24A1Q17RW2 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
COL24A1Q17RW2 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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