Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RPS13P2-201ENST00000437890 455 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TMEM150C-203ENST00000508701 566 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC078929.1-201ENST00000547679 502 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTF1Q16619 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms