Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
GAPVD1Q14C86 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms