Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AP001372.3-201ENST00000530510 609 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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