Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTCH1Q13635 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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PTCH1Q13635 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTCH1Q13635 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTCH1Q13635 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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