Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms