Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02011-201ENST00000566553 3830 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01834-201ENST00000567374 385 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009107.2-201ENST00000569580 577 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022748.2-201ENST00000569846 568 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009271.1-201ENST00000589440 518 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AURKC-206ENST00000598785 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DPPA5P1-201ENST00000600430 340 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009061.2-204ENST00000602476 524 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.46-201ENST00000611137 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359644.1-201ENST00000635872 471 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTBN2-211ENST00000617502 3498 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB43-201ENST00000373457 5695 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJB8-202ENST00000469083 3365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GJA5-203ENST00000621517 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf116-202ENST00000461135 3142 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF21-201ENST00000237316 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP69-213ENST00000497910 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 JRKL-201ENST00000332349 2855 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN26-206ENST00000619937 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPRE2-204ENST00000538170 4093 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EFCAB12-201ENST00000326085 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF136-201ENST00000343979 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 APPL2-213ENST00000551662 2190 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP1-218ENST00000581527 3525 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ILK-202ENST00000396751 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CDKL2-202ENST00000429927 3383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MTRR-201ENST00000264668 3274 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.1 ms