Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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CCDC93Q567U6 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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CCDC93Q567U6 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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CCDC93Q567U6 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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CCDC93Q567U6 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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CCDC93Q567U6 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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CCDC93Q567U6 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CCDC93Q567U6 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CCDC93Q567U6 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CCDC93Q567U6 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CCDC93Q567U6 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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