Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAM2Q15035 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms