Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SMCO1Q147U7 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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