Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms