Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NMBRP28336 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NMBRP28336 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
NMBRP28336 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
NMBRP28336 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NMBRP28336 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NMBRP28336 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms