Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTPREP23469 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC009163.7-201ENST00000621929 2557 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GAPDHP55-201ENST00000423136 803 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC01515-209ENST00000599409 755 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 OR8D4-202ENST00000641687 2904 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AURKA-205ENST00000395911 2145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZFP2-205ENST00000523286 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SOSTDC1-202ENST00000396652 2411 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 NPL-203ENST00000367553 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 C10orf25-201ENST00000625168 3078 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNU1-11P-201ENST00000383975 164 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms