Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CNTN3Q9P232 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CNTN3Q9P232 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CNTN3Q9P232 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CNTN3Q9P232 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CNTN3Q9P232 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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