Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
FXNQ16595 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FXNQ16595 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms