Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USF2Q15853 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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