Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
GAPVD1Q14C86 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
GAPVD1Q14C86 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms