Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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