Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MSCO60682 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MSCO60682 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MSCO60682 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MSCO60682 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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