Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KIAA1549Q9HCM3 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms