Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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