Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms