Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms