Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFG3L2Q9Y4W6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFG3L2Q9Y4W6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFG3L2Q9Y4W6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFG3L2Q9Y4W6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFG3L2Q9Y4W6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFG3L2Q9Y4W6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFG3L2Q9Y4W6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AFG3L2Q9Y4W6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFG3L2Q9Y4W6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms