Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL11Q9Y3B7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL11Q9Y3B7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms