Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms