Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVW-1Q9UQF0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVW-1Q9UQF0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVW-1Q9UQF0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVW-1Q9UQF0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVW-1Q9UQF0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVW-1Q9UQF0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVW-1Q9UQF0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVW-1Q9UQF0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms