Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHOC2Q9UQ13 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHOC2Q9UQ13 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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