Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IGSF9BQ9UPX0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms