Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRQQ9UN88 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRQQ9UN88 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms