Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BARX2Q9UMQ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms