Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLEC4EQ9ULY5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4EQ9ULY5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms