Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNRF3Q9ULT6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNRF3Q9ULT6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms