Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRPF3Q9ULD4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms