Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP68Q9UHB9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP68Q9UHB9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms