Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX1-2Q9UD57 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX1-2Q9UD57 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX1-2Q9UD57 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX1-2Q9UD57 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX1-2Q9UD57 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX1-2Q9UD57 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX1-2Q9UD57 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX1-2Q9UD57 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NKX1-2Q9UD57 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NKX1-2Q9UD57 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms