Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL42Q9P2K6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL42Q9P2K6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms