Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP35Q9P2H5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP35Q9P2H5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
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