Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMG20BQ9P0W2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms