Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMOD3Q9NYL9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMOD3Q9NYL9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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