Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM53CQ9NYF3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms