Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED17Q9NVC6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms