Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMBRD1Q9NUN5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1Q9NUN5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms