Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC18Q9NUE0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC18Q9NUE0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms