Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB4Q9NTQ9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB4Q9NTQ9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms