Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DEPPQ9NTK1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEPPQ9NTK1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms