Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG3Q9NT62 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms