Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EMILIN3Q9NT22 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EMILIN3Q9NT22 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms